تركز برامج درجة الماجستير والدكتوراه متعددة التخصصات بجامعة خليفة على المهارات والقطاعات الأكثر طلبًا على الصعيدين الإقليمي والدولي. يمنح أعضاء الهيئة الأكاديمية المشهورون دوليًا الطلبة تدريبًا عمليًا وإرشادًا ليصبحوا حلاً للمشكلات على مستوى عالمي. يعمل الطلبة في مختبراتنا المتطورة وفي الموقع مع شركائنا في الصناعة لصقل مهاراتهم العلمية والتقنية. حتى الآن، منحت جامعة خليفة أكثر من 1800 درجة ماجستير ودكتوراه للطلبة المؤهلين. يتم تقديم برامج الدراسات العليا، على مستويي الماجستير والدكتوراه، في كل من كلية الهندسة وكلية الآداب والعلوم. تقدم الجامعة 18 برنامجًا لدرجة الماجستير، يقدم بعضها تركيزًا اختياريًا، وستة برامج لدرجة الدكتوراه، يقدم أحدها أحد عشر تخصصًا اختياريًا.
تتيح جامعة خليفة للعلوم والتكنولوجيا مجموعة من البرامج الدراسية المصممة لمواصلة المعرفة التخصصية المتقدمة واكتساب المهارات المتطورة في مجالات الهندسة والطب والأمن والعلوم والتكنولوجيا. ينخرط الطلبة في بحوث رائدة ويشاركون في صياغة حلول مبتكرة للتحديات العالمية المعاصرة. تتيح البرامج المنتقاة أيضًا التركيز على المهمة الدراسية المطلوبة لإتمام المنهج في مجال يختارونه عبر مسار اختياري.